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Tth Argonaute (TtAgo)

¥432
货号:Y3445-50PMOL
品牌:YIKE
规格:
  • 50 pmol
数量:

产品信息

产品名称

产品编号

规格

Tth Argonaute (TtAgo)

G3434-50PMOL

50 pmol


产品简介

本产品Tth Argonaute (TtAgo),是由大肠杆菌重组表达的Thermus thermophilus来源的DNA引导的序列特异性DNA内切酶。其活性发挥必须依赖一段短的(16-18 nucleotide)5’磷酸化的单链DNA(sgDNA)作为介导,切割区域不需要Cas9 Nuclease需要的PAM区域,但Tth Argonaute (TtAgo)只含有一个切割活性位点,只能断裂与sgDNA互补的第10与11位碱基之间的磷酸二酯键。可以高效切割单链DNA以及大部分双链DNA底物(在双链DNA上产生单链断裂),对单链RNA底物有中等切割活性,对双链RNA底物无切割活性。TtAgo在65-85℃温度范围内具有活性,常规反应温度为75-80℃,如果温度低于70℃活性会大幅度下降。在体外实验体系中,sgDNA的摩尔量应超过TtAgo的5倍,否则容易出现非特异性活性。

用途:体外单链DNA、双链DNA剪切等。

来源:Thermus thermophilus来源核酸内切酶,大肠杆菌重组表达。

纯度及浓度:SDS-PAGE检测纯度≥95%,无RNase残留,1 μM。

酶储存缓冲液:10 mM Tris-HCl, 300 mM NaCl, 1 mM DTT, 0.1 mM EDTA, 50%(v/v) glycerol, pH 7.4。

TtAgo Reaction Buffer(10х):200 mM Tris-HCl, 100 mM (NH4)2SO4, 100 mM KCl, 20 mM MgCl2, 1%Triton X-100, pH 8.8。


image.png

 

图1. Tth Argonaute (TtAgo)切割单链DNA效果图。反应体系:4 μL ddH2O、1 μL 10хReaction Buffer、2 μL 10 μM靶ssDNA(sequence:5’-CTTGCTCTAGGCCGCGATTAAATTCCAACATGGATGCTGATTTATATGGGTATAAATGG-3’)、2 μL 50 μM sgDNA(Target sequence:5’-TGTTGGAATTTAATCG-3’)、1 μL TtAgo(分别为2、1、0.6、0.3 pmol),80℃孵育30 min进行反应,反应完毕后立即冰浴。然后进行20% TBE-PAGE实验(恒压110V电泳150 min)之后用EB室温染色15 min,即可观察结果。由图中可以看到sgDNA与TtAgo结合后,引导后者至靶ssDNA与sgDNA互补的序列酶切产生39 nt和20 nt的片段。


储存与运输

冰袋(wet ice)运输;-20℃保存,12个月有效期。


组成

Component Number

Component

G3434-50PMOL

G3434-1

Tth Argonaute (TtAgo)

50 μL

G3434-2


TtAgo Reaction Buffer(10х)


500 μL

说明书

1份



操作步骤

1. 准备好体外消化反应各种试剂[将Tth Argonaute (TtAgo)、ssDNA Guide Oligonucleotide、底物DNA、TtAgo Reaction Buffer(10х)于冰浴上];

2. 配制反应体系(以20 μL体系为例,可以进行适当调整):

Reagent

Volume

ssDNA or dsDNA

UP to 1 pmol

TtAgo Reaction Buffer(10х)

2 μL

ssDNA Guide Oligonucleotide (5 μM)

1 μL(5 pmol)

Tth Argonaute (1 μM)

1 μL(1 pmol)

Nuclease-free water

To 20 μL

注:ssDNA Guide Oligonucleotide必须5’磷酸化(推荐使用G3458 T4 Polynucleotide Kinase实现ssDNA磷酸化或直接合成磷酸化ssDNA),其最适长度为16-18 nt;

3. 涡旋混匀后室温离心数秒,使液体聚于管底,80℃孵育30-60 min;

4. 迅速将体系置于4℃以终止反应(TtAgo在65℃以下无活性);也可每个体系中加入1 μL蛋白酶K(20 mg/mL,货号G1234)室温孵育10 min以终止反应;

5. 反应体系可以直接用适当浓度的琼脂糖凝胶进行电泳分析。如不立即电泳,可以将体系置于-20℃备用。


注意事项

1. 酶制品使用时应放在冰盒内或冰上,建议分装使用,使用完毕后应立即置于-20℃保存。

2. 在体外实验体系中,sgDNA的摩尔量应超过TtAgo的5倍,否则容易出现非特异性活性。

3. TtAgo的活性受Mg2+、Mn2+影响很大,如果出现不切割或非特异性切割可以通过调整浓度解决。

4. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。


产品仅供科研用途,不用于临床诊断!



(产品包装升级中,以实物为准。


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注意事项

  • 请在保质期内使用本产品
  • 请存放于阴凉干燥处,避免阳光直射
  • 使用前请仔细阅读产品说明书
  • 如有不适,请立即停止使用并咨询专业人士
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