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SmallRNA测序

¥2000
货号:YM3015
品牌:YIKE
规格:
数量:
服务介绍: miRNA(micro RNA,微小RNA/微RNA):是广泛存在于真核生物中的一类内源的、长度约为20~25个核苷酸的非编码RNA,其通过与靶RNA特异性结合导致靶RNA翻译抑制或降解,从而调控蛋白的翻译过程。 货号 名称 规格 价格(元) GM3004 SmallRNA测序 样 2000 实验流程: 实验结果展示: 1、 差异miRNA聚类热图: 2、 miRNA 和靶基因局部网络图: 3、 显著富集 KEGG pathway 散点图: 实验流程: 样本准备-RNA抽提与质检-文库构建-上机测序 送样运输要求: 样本要求: 1) 样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。 2)样品的量:新鲜组织 ≥300mg, 细胞样品≥1×10 7 个, RNA样品需提供10μg以上的总RNA 3)样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。 4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。 5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。 相关问题: 1. 小RNA(small RNA)的种类有哪些? Small RNA包括三类,microRNA(miRNA)、small interfering RNA(siRNA)和piRNA。 miRNA:长度为20-24个核苷酸的小RNA,是发夹结构约70-90个核苷酸的前体RNA经Dicer酶加工后形成。miRNA主要是通过和AGO蛋白结合,通过碱基互补配对的方式和mRNA结合,通过剪切mRNA ORF区域或结合在UTR区对mRNA翻译过程进行抑制,从而调控生物体内蛋白的合成。 siRNA:20-25个核苷酸的双股RNA,参与RNA干扰。 piRNA:与piwi蛋白相互作用的RNA,长度大约26-31个核苷酸。主要存在于哺乳动物的生殖细胞和干细胞,通过与piwi亚家族蛋白结合形成piRNA复合物(piRC)来调控基因沉默途径。 2. Small RNA测序,样本有什么要求? 样品类型:细胞、新鲜组织、血液RNA样品。 样品量:细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,RNA样品请提供10 μg以上的总RNA。 样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。 3 . 做miRNA预测,若样本是血清血浆,一般需要多少样本量? 赛维尔可做血清血浆miRNA预测,但是由于不同样本差异较大,如果提取的RNA量太少,不能保证后续测序可以进行。提取一次RNA需要血清500uL,一般需要客户提供2mL的血清样本,血清和血浆需要客户自己分离。 4. 若客户提供RNA做miRNA预测,样本量和浓度有什么要求? 样本要求:OD值260/280:1.8~2.0;浓度:100ng/uL左右;总量:2ug左右。 5 . smallRNA的 测序模式? 测序模式是1×50,5~10M reads/sample。 6 . miRNA的主要分析内容有那些?新miRNA预测需要参考基因组吗? 原始测序结果分析、序列比对、新miRNA预测、miRNA差异表达分析、差异miRNA靶标基因预测,差异靶标基因GO和KEGG功能分析,Disease注释功能分析,Reactome通路分析,蛋白质互作网络图,miRNA家族分析,miRNA 突变检测。新miRNA预测需要参考基因组。 仅供科研用途,不可用于临床诊断!

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