全国400热线:4008-2525-86

Product Image

16S/18S/ITS等扩增子测序(二代)

¥99
货号:YM3017
品牌:YIKE
规格:
数量:
服务介绍: 扩增子测序:提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。基于DNBSEQ-G99基因测序仪,可对动物粪便、土壤等环境样本测序,适用于微生物16S/18S/ITS、宏基因组测序等科研场景。 货号 名称 规格 价格(元) GM3006 16S/18S/ITS等扩增子测序(二代) 样 139 16S送样登记单.xlsx 分析内容: 实验结果展示: 1、物种组成柱状图 2、物种相对丰度热图 3、PCoA主成分分析 4、差异分析LEfSe条形图 实验流程: TotalDNA抽提与质检-目标区域PCR扩增-文库构建-上机测序-数据分析; 送样运输要求: 以下所有样本必须在送样管上标记清楚样本编号,-80℃冰箱冻存(-80℃冻存时间不超过 六 个月),全程干冰运输送样 。采集的标本应盛于无菌容器内,确保所采集的标本无外源性的污染。 16s原则上不返样,确需返样务必提前说明, 建议合理送样,如送样量过多会进行销毁 。 一、 粪便样本 A. 带上手套收集新鲜的粪便样品,人的粪便量为500mg,大鼠为1-2粒,小鼠为3-5粒,收集后分装至 2mL EP 管(无菌)或冻存管(无菌)中,迅速放入液氮中速冻,之后放于-80℃或液氮中长期保存,干冰送样。 B. 人的粪便样本可用无菌牙签或粪便取样器截取样品中段内部(避免表层中的肠道膜脱落细胞),外部容易污染且细菌DNA 由于接触空气可能有降解。 二、动物肠道内容物样本 1 普通动物肠道内容物 A. 在实验对象死亡后,无菌条件下,取出整个肠道,用无菌解剖刀切取所需肠段。用无菌手术刀挖取内容物,并立即放在冰上进行分装及标记将已取的样品分装至2mL EP 管(无菌)或冻存管(无菌)中,每管组织量为0.5~1g,每个样品分装2~3 管备份,迅速放入液氮中速冻,之后放于-80℃或液氮中长期保存,干冰送样。 B. 注意事项:一些肠道内容物较难取样的可以取肠道样本作为研究对象,此类型样本无法出去宿主本身的核酸,检测建库结果存在宿主基因的风险,若介意宿主基因干扰,需要分离出肠道内溶物再送样。液氮速冻,-80℃长期保存,干冰运输。注意若为微生物多样性Q-MCD 产品类型的样本,样本量每管组织量为0.5~2g,太少无法准确称量样本重量。 2 飞虱类昆虫肠道样本 A. 取褐飞虱成虫200+头,用冰(-20℃冷冻)使其昏迷,用70%乙醇进行表面灭菌处理,在用灭菌水漂洗数次。 B. 解剖镜下用镊子夹住飞虱的头胸部和腹末,轻轻用力将肠道以及内脏器官拉出,用灭菌水漂洗,去除卵巢、脂肪以及其他内脏器官,取出肠道放于1.5mL离心管,每管组织量为0.25~0.5g,每个样品分装2 管备份分装好后样本迅速放入液氮中速冻,之后放于-80℃或液氮中长期保存,干冰送样。 三、土壤样本 1 普通土壤样本 A. 根据研究目的选择有代表性的取样地点及采样点。 B. 除去土壤表层未分解的凋落物层,用已灭菌的刀或铲去除表层5cm 的土壤,再用烧灼过的勺、铲或土壤取样器取样10-25g,装于无菌塑料封口袋内,多 点样本均匀混合(注意保留适当空间) ,标明采样地点,深度、日期等信息。 C. 两天内常温或冰袋运送到实验室,除去动植物残体、石砾等杂质,将大块的样品捣碎,过2mm 筛后,分装至2mL 或更大体积的EP 管或冻存管中;每管 土壤含量大概0.25~0.5g,需保证送样量在1~2g,若土壤含微生物较少,需增加送样量。 D. 未分装样本4 ℃保存时间不要超过一个月,分装后样本-80℃或液氮中长期保存,干冰送样。 2 根际土壤样本 A. 收集植物植株,去除根部大块土壤;摇动植株去除附着不紧密的土壤,使用无菌刷子收集根部附着紧密的土壤;随机多点取样5-10g,装于无菌塑料封口袋 内,多点样本均匀混合(注意保留适当空间) ,标明采样地点,深度、日期等信息。 B. 两天内常温或冰袋运送到实验室,除去动植物残体、石砾等杂质,将大块的样品捣碎,过2mm 筛后,分装至2mL 或更大体积的EP 管或冻存管中;每管土 壤含量大概0.25~0.5g,需保证送样量在1~2g,若土壤含微生物较少,需增加送样未分装样本4 ℃保存时间不要超过一个月,分装后样本-80℃或液氮中长期保存,干冰送样。 3 淤泥样本 A. 根据研究目的选择有代表性的取样地点及采样点。 B. 采集污泥样品,放于无菌离心管或其它无菌容器中。 C. 4 小时内常温带回实验室中分装至2mL EP 管或冻存管中;或用PBS 进行清洗,使用PBS 的体积需是淤泥样本的3-10 倍,摇床混匀孵育1-2h 或者使用超声波清洗仪清洗15-30min,瞬离(转速达到800g 即可停止),将上清液转至新的合适体积的离心管中,8000g 4℃离心10min 收集沉淀或下层,分装于2 mL 离心管中;每个样品至少2g。 D. 分装后样本迅速液氮速冻,之后放于-80°C 或液氮中长期保存,干冰送样。 4 水体样本 A. 根据研究目的选择有代表性的取样地点及采样点。 B. 采用多点取样法取样,采样时不可搅动水底的沉积物;避免手指和其他物品对瓶口的沾污。 C. 取样后4 小时内(期间4 ℃避光保存)真空抽滤、富集菌体(平行重复样本可用同一滤膜过滤)。 D. 带有富集菌体的干燥滤膜剪碎或折叠后(直接保存,剪碎或者折叠有可能吸附菌体的一面会粘在一起,不利于提取时裂解洗脱菌体)保存在2mL 或5mL 无菌EP 管中, -20℃或-80℃保存,干冰送样。 E. 如果没有滤水设施,可将水体收集后,使用50ml 无菌离心管8000g 4℃离心10min 收集下层, -20℃或-80℃保存,干冰送样。 F. 注意事项: a. 过滤大量低微生物含量的清亮水样用0.22μm 的聚苯醚砜滤膜(Polyethersulfone),每个样本至少1L 水样。 b. 浑浊水样使用0.22μm 滤膜过滤缓慢容易堵塞时,建议使用0.45μm 的混合纤维素酯滤膜(膜醋酸纤维素、硝酸纤维素);如水体中含有杀虫剂和除草剂,则避免使用这类滤膜;每个样本0.5L-1L 水样,如有堵塞则将同一样本滤膜保存于一管。 c. 如果水样中不可溶解的颗粒较多,需要使用2-5μm 孔径的滤膜将不可溶解的颗粒杂质滤去,再使用0.22μm 或0.45μm 的滤膜富集菌体;每个样本0.5L-1L 水样,如有堵塞需则同一样本滤膜保存于一管。 d. 如果研究的是病毒,则需先用0.22μm 滤膜把水中的细菌和其它大个头细胞过滤掉,再用带正电荷滤膜( Virozorb 的1MDS 或NanoCeram 的Virus Sampler cartridges)富集病毒;每个样本20L 水样。 e. 微生物含量低的清亮水体可使用多管50ml 分装离心,合并下层进行二次离心富集,富集后体积不能太大(200ul-500ul),需要一次性提取全部富集体积样本。 四、物体表面微生物样本 A. 根据研究目的选择有代表性的取样地点及采样点。 B. 采集样品,放于无菌离心管或其它无菌容器中。 C. 4 小时内常温带回实验室中,取10g 样品(评估物体表面微生物含量确定样本量,...

相关产品

注意事项

  • 请在保质期内使用本产品
  • 请存放于阴凉干燥处,避免阳光直射
  • 使用前请仔细阅读产品说明书
  • 如有不适,请立即停止使用并咨询专业人士
服务推荐
货号名称规格价格操作
产品推荐
货号名称规格价格操作
广州一科生物科技有限公司
广州一科生物科技有限公司
电话:4008-2525-86
020-28936965
020-83625189
邮箱:weikexie@163.com
地址:广州市白云区白灰场南路润祥大厦B栋707
粤ICP备19145173号-1版权所有 All rights reserved 广州市一科生物科技有限公司
本公司产品仅供体外研究使用,不用于临床诊断!
  • 我的收藏
  • 咨询客服

    请填写您的信息,我们会尽快安排对应人员与您联系!

    单位名称:
    您的姓名:
    联系电话:
    咨询内容:
  • 联系电话

    客服电话:

    4008-2525-86

    020-28936965

    020-83625189

  • 返回顶部