真核有参转录组测序(6G)
¥299
货号:YM3012
品牌:YIKE
规格:
- 样
数量:
服务介绍: 转录组测序(mRNA-seq):基于华大DNBSEQ-T7测序平台,对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,经定量和差异分析,获得不同比较组合下差异表达的基因,再基于GO和KEGG等数据库对差异表达基因进行功能注释和富集分析。该平台日产出数据量可高达7 Tb,广泛适用于全基因组测序、超深度外显子组测序、表观基因组测序、转录组测序等大型测序项目。 货号 名称 规格 价格(元) GM3001 真核有参转录组测序(6G) 样 349 转录组送样登记单.xlxs 分析内容: 实验结果展示: 1、样品相关性热图 2、差异基因火山图 3、差异表达基因聚类热图 4、富集分析气泡图 实验流程: 样本处理-TotalRNA抽提与质检-文库构建-PE150测序-数据分析; 送样运输要求: 以下所有样本必须在送样管上标记清楚样本编号,-80℃冰箱冻存(-80℃冻存时间不超过一个月,避免反复冻融导致RNA降解),全程干冰运输送样。组织样本建议用组织RNA稳定保存液( G3019 )进行保存。 一、动物组织样本 1、动物处死后5min内取样,全程冰上操作,先取易降解的组织,如胰腺、肠、胃等,再取其它组织,组织块至少取50mg以上(黄豆大小)。组织取好后用预冷的PBS轻轻漂洗掉样本表面的血污,例如心、肝、脾、肾等血污较多的组织,可用预冷PBS清洗多次,直至血污清洗干净,用滤纸吸干组织表面液体,立即放入EP管或冻存管中液氮速冻5min后,转移到-80℃冰箱保存;或迅速完全浸泡于5~10倍体积的RNAsolidTM组织RNA稳定保存液( G3019 )中,4℃渗透过夜,转移到-80℃冰箱保存;干冰送样。 2、肠,胃,血管,食管,子宫等标本,取材后立即把组织切开用预冷PBS清洗多次,去除内容物,用滤纸吸干组织表面液体,立即放入EP管或冻存管中液氮速冻5min后,转移到-80℃冰箱保存;或迅速完全浸泡于5~10倍体积的RNAsolidTM组织RNA稳定保存液( G3019 )中,室温渗透半小时后,转移到-80℃冰箱保存;干冰送样。 3、脊髓,主动脉,气管,神经等标本长度不得少于1cm。 4、视网膜需单独剥离,小鼠至少需要4个视网膜合并,大鼠至少需要2个视网膜合并。 5、卵巢需单独剥离,去除周围脂肪,小鼠至少需要2个卵巢合并。 6、皮肤样本需去净毛发。 如有特殊特定部位取材,必须提前分离好送样,实验室不进行指定部位取材操作。 二、细胞样本(细胞量至少106) 1、悬浮细胞: 培养结束后,离心去除培养液:收集的细胞用PBS缓冲液快速冲洗2次,低速离心除去PBS缓冲液;在操作过程中应轻柔,防止细胞破碎,低速离心除去PBS缓冲液:每1~5×10 6 个细胞加入1mL RNA提取液(G3013)(用1ml吸头反复吹打细胞至看不见成团的细胞块,整个溶液呈清亮不粘稠的状态),使样品管在室温放置10min,放入干冰或-80℃冰箱中保存,干冰送样。 2、贴壁细胞: 培养结束后,吸取去除培养液,用PBS缓冲液快速冲洗2次(贴壁牢固可以先用胰酶消化后再继续下述操作);按每10cm 2 培养面积(相当于六孔板一个孔或35mm直径培养血)加入1mL RNA提取液(G3013)的比例,用1mL吸头反复吹打至看不见成团的细胞块,整个溶液呈清亮不粘稠的状态,使RNA提取液接触所有长有细胞的培养皿表面,并进行充分消化。转移到RNase-free的1.5mL或2mL离心管中,放入干冰或-80℃冰箱中保存,干冰送样。 三、全血样本 EDTA 抗凝管采集新鲜血液 0.7mL,直接加入 3 倍体积的 RNA提取液(G3013),充分震荡混匀后,室温孵育5min,-80℃冰箱保存,干冰送样。 三、 提取好的RNA干冰运输,不要再加入保存液或提取液。RNA质量2ug以上,体积20ul以上,OD260/OD280在1.8到2.0之间。 仅供科研用途,不可用于临床诊断!
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